Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Irx1P81068 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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