Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx3P81067 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms