Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms