Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msx3P70354 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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