Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf5P70191 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf5P70191 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf5P70191 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms