Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbdsP70122 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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