Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snrpd3P62320 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms