Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps11P62281 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms