Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Paxbp1P58501 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms