Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp1P56183 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp1P56183 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp1P56183 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrp1P56183 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms