Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb3P54285 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms