Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PctpP53808 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PctpP53808 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PctpP53808 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms