Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ClgnP52194 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClgnP52194 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms