Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LtbrP50284 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms