Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rfx1P48377 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx1P48377 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms