Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gli1P47806 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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