Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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VhlP40338 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VhlP40338 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VhlP40338 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VhlP40338 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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