Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ThpoP40226 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ThpoP40226 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms