Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms