Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2aP35436 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin2aP35436 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms