Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rab20P35295 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rab20P35295 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab20P35295 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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