Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nedd1P33215 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms