Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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