Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc10P31257 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc10P31257 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms