Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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