Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms