Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa5P28312 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms