Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms