Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6aP27664 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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