Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd12P23812 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms