Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PparaP23204 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PparaP23204 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PparaP23204 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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PparaP23204 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PparaP23204 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PparaP23204 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PparaP23204 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PparaP23204 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms