Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RarbP22605 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RarbP22605 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RarbP22605 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms