Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tap1P21958 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms