Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms