Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms