Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a1P19437 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a1P19437 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms