Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hoxb1P17919 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hoxb1P17919 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hoxb1P17919 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hoxb1P17919 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hoxb1P17919 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hoxb1P17919 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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