Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcnaP17918 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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