Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms