Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cxcl2P10889 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cxcl2P10889 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cxcl2P10889 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms