Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms