Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf1P09925 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms