Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
TtrP07309 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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TtrP07309 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TtrP07309 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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