Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccl20O89093 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl20O89093 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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