Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp4O70480 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms