Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpd52l1O54818 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms