Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ColqO35348 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ColqO35348 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms