Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd2O35245 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2O35245 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms