Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Casq1O09165 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Casq1O09165 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms