Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tcof1O08784 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcof1O08784 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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